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怎么把pdb文件提取受体

作者：晨曦发布时间：2023-02-08浏览：460

把pdb文件提取受体：可以用perl写个脚本，先一个一个的打开pdb文件，然后读出以SEQRES开头的行，并写入到一个新的文件中。点击download selected 后，应该是又出来一个网页，分成三部分：Structure Download，FASTA File Download，RCSB PDB File Download Services。

你是你是想下载structure，你可以在Download Type处，选择PDB Format 就行了，然后再下载。

坐标部分：MODEL: 多亚基时显示亚基号当一个PDB文件中包含多个结构时(例: NMR结构解析), 该记录出现在各个模型的第一行，MODEL记录行的第11-14列上记入模型序号。序号从1开始顺序记入, 在11-14列中从右起写. 比如说有30个模型, 则第1至9号模型, 该行的7-13列空白, 在14列上记入1-9的数字; 第10-30号模型, 该行的7-12列空白, 13-14列上记入10-30的数字。ATOM: 标准残基的原子. 记述标准残基(氨基酸以及核酸)中各原子的原子名称, 残基名称, 直角坐标(单位埃), 占有率, 温度因子等信息。

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怎么把pdb文件提取受体

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