1、外形不同

海葵：海葵的单体呈圆柱状，柱体开口端为口盘、封闭端为基盘。口盘中央为口，口部周围有充分伸展的软而美丽的花瓣状触手，犹如生机勃勃向日葵，因而得名。

海参：海参虽为圆筒状，但粗细、形状和大小随种类不同而有很大的差异。常见的大型食用海参均为较粗壮的圆筒状，背面有疣足，腹面有管足如海参属（Holothuria）、刺参属（Stichopus）、仿刺参属（Apostichopus）、辐肛参属（Actinopyga）和白尼参属（Bohadschia）等。

2、生活习性不同

海葵：各大洋都有分布，从潮间带到超过10,000公尺(约33,000呎)深处，有的生活在淡咸水里。海葵广布于海洋中，多数栖息在浅海和岩岸的水洼或石缝中，少数生活在大洋深渊，最大栖息深度达10210米。在超深渊底栖动物组成中，所占比例较大。这类动物的巨型个体一般见于热带海区，如口盘直径有1米的大海葵只分布在珊瑚礁上。

海参：海参分布世界各海，种类最多的是印度洋—西太平洋区，尤其是食用海参，大多分布在热带珊瑚礁内。我国北方只有一种食用海参，即刺参，而海南岛和西沙群岛却产有十几种食用海参。食用海参大多生活于潮间带或浅海。深海甚至深渊也有海参分布，它们大多数是平足目海参。

3、价值不同

海葵：海葵毒素有很大用途。如：1974年奎恩等人曾用沙岩海葵的三种酒精抽提物，注射患艾氏腹水癌的小白鼠，当剂量为84毫微克/公斤（即每公斤体重的小白鼠注射0.000000084克）时，100%地抑制了腹水癌的生长，癌细胞被杀死，30天内癌体消失，90天内完全恢复健康。此外，对强心、扩张血管等也是十分有效。

海参：几百年前，我国人民就认为海参不仅是一种佳肴，而且还是一种滋补保健品。明朝万历年间谢肇制著《五杂俎》就有关于海参的记载。清朝赵学敏编的《本草纲目拾遗》有这样的叙述：“海参性温补，足敌人参，故名海参；味甘咸，补肾经，益精髓，消痰延，摄小便，壮阳疗痿，杀疮虫”。《药鉴》和《药性考》上，对于海参的药用价值有更详尽的记载。

现代药理研究表明，海参具有多种活性成分，具有抗肿瘤、调节免疫力、抗氧化等多种药理作用。